환경 요인을 통합한 한우 유전체 기반 데이터셋
목차 요약영상 3 Videos 데이터 준비중 0:03 모델링 준비중 0:03 데이터분석 준비중 0:03 저자정보 출판이력 DOI 인용 다운로드 Print 구글문서 Print 구글문서 1. 질문 한우의 품질을 나타내는 한우의 속성은 어떤 것이 있나요? 2. 데이터 작성 2.1. 배경 (Background) 어떤 방법이 딸기의 당도를 증가시키는 것이 확인된다면, 딸기 생산자는 이 방법을 활용하여 딸기의 품질을 개선하고, 유통업자는 더 […]
정수, 유리수, 무리수, 실수 중에서 연속인 수체계는?
목차 실수입니다. 연속성의 필요성: 연속성이 보장된 실수 함수 위에서만 미분과 적분이 성립됩니다. 시간, 거리, 온도 등의 연속적인 양은 실수로 표현되어야 합니다. 극값을 정의하고 분석하기 위해서는 함수가 연속적이어야 하며, 이러한 연속성은 실수 공간에서 보장됩니다. 1. 수체계 수체계(Number System)는 수학적 연산과 논리 체계 내에서 수의 집합들을 공리적으로 정의하고, 그 위상 및 대수적 구조에 따라 분류한 계층적 구조입니다. […]
선형모형을 이용한 SNP 마커 효과 분석 : ANOVA 모형을 이용한 마커의 평균 효과 추정
목차 요약영상 3 Videos 데이터 준비중 0:03 모델링 준비중 0:03 데이터분석 준비중 0:03 저자정보 출판이력 DOI 인용 다운로드 Print 구글문서 Print 구글문서 선형모형을 이용하여 단일염기변이(Single Nucleotide Polymorphism, SNP)의 효과를 추정하는 방법론은 유전체 정보를 이용하여 개체의 유전능력을 추정하는 가축육종(Animal Breeding) 분야에서 매우 중요한 내용일 것이다. 이번 장에서는 선형모형의 일종인 회귀분석과 분산분석의 개념적 차이 및 개별 방법론에 […]
정규분포를 따르는 확률변수의 벡터가 생성하는 표현공간에서의 결합확률분포는 무엇?
목차 다변량 정규분포(multivariate normal distribution)입니다. 변량은 확률변수의 실제 관측값을 의미합니다. 어떤 확률공간 $(Omega, mathcal{F}, P)$ 위에 정의된 정규분포 확률변수 벡터 $ mathbf{X} = (X_1, ldots, X_n)^top $가 있을 때, 그 벡터가 표현공간 $ mathbb{R}^n $에서 따르는 결합확률분포 $ P_{mathbf{X}} $는 다변량 정규분포 $mathcal{N}(boldsymbol{mu}, boldsymbol{Sigma})$입니다. 확률변수는 항상 어떤 확률공간 ($Omega$, $mathcal{F}$, $P$) 상에 정의됩니다. 정규분포를 나타내는 […]
다변량 정규분포는 여러 개의 정규분포를 합친 것인가?
목차 아니요, 변량(확률변수값) 간의 상관이 있어야 합니다. 다변량 정규분포는 정규성과 상관이 있는 확률변수들을 원소로 하는 벡터의 확률분포입니다. 개체의 속성이 정규분포를 나타내고 개체의 속성이 서로 상관을 가질 때 개체가 이루는 집단의 속성의 분포는 확률변수 벡터로 표현되며 그 벡터는 다변량 정규분포를 나타냅니다. 다변량 정규분포를 나타내는 대표적인 확률변수 벡터로는 집단의 육종가 벡터가 있습니다. [mathbf{a} = begin{pmatrix}a_1 \a_2 \vdots […]
정규분포는 표본의 평균과 분산이 독립인 유일한 확률분포인가요?
목차 네, 정규분포의 표본평균과 표본분산은 확률변수이고 독립입니다. 정규분포 $mathcal{N}(mu, sigma^2)$ 에서 추출된 모든 $n geq 2$의 표본에서 표본평균($ bar{X}$)과 표본분산$(S^2)$은 독립입니다. $$bar{X} perp S^2$$ 표본의 평균과 분산이 독립이라는 것은 어느 표본의 평균값을 알아도 분산값을 예측할 수 없고 반대도 마찬가지라는 것입니다. 1. 정규분포 정규분포 $X sim mathcal{N}(mu, sigma^2)$의 확률밀도함수는 다음식으로 표현됩니다.$$f(x) = frac{1}{sqrt{2pi sigma^2}} expleft( -frac{(x […]
한우의 근내지방도 예측을 위한 유전 혼합선형모델 – ssGBLUP
목차 요약영상 1 Videos 모델링 3:54 저자정보 출판이력 DOI 인용 다운로드 Print 구글문서 Print 구글문서 1. 혼합선형모델 1.1. 혼합선형모델식 혼합선형모델을 다음식과 같이 표현할 수 있습니다. $$mathbf{y} = mathbf{X} boldsymbol{beta} + mathbf{Z}_a mathbf{a} + mathbf{Z}_g mathbf{g} + boldsymbol{varepsilon}$$ 여기서, $mathbf{y}$ : 종속변수(반응변수)$mathbf{X}$ : 고정효과 설계행렬 (독립변수, 설명변수)$boldsymbol{beta}$ : 고정효과 회귀계수$mathbf{Z}_a$ : 혈통 랜덤효과 설계행렬$mathbf{a}$ : 혈통 […]
한우의 근내지방도 예측을 위한 혈통 혼합선형모델 – PBLUP
목차 요약영상 1 Videos 모델링 3:54 저자정보 출판이력 DOI 인용 다운로드 Print 구글문서 Print 구글문서 1. 혼합선형모델 1.1. 혼합선형모델식 혼합선형모델을 다음식과 같이 표현할 수 있습니다. $$mathbf{y} = mathbf{X} boldsymbol{beta} + mathbf{Z}_a mathbf{a} + mathbf{Z}_g mathbf{g} + boldsymbol{varepsilon}$$ 여기서, $mathbf{y}$ : 종속변수(반응변수)$mathbf{X}$ : 고정효과 설계행렬 (독립변수, 설명변수)$boldsymbol{beta}$ : 고정효과 회귀계수$mathbf{Z}_a$ : 혈통 랜덤효과 설계행렬$mathbf{a}$ : 혈통 […]
한우의 근내지방도 예측을 위한 유전체 혼합선형모델 – GBLUP
목차 요약영상 1 Videos 모델링 3:54 저자정보 출판이력 DOI 인용 다운로드 Print 구글문서 Print 구글문서 1. 혼합선형모델 1.1. 혼합선형모델식 혼합선형모델을 다음식과 같이 표현할 수 있습니다. $$mathbf{y} = mathbf{X} boldsymbol{beta} + mathbf{Z}_a mathbf{a} + mathbf{Z}_g mathbf{g} + boldsymbol{varepsilon}$$ 여기서, $mathbf{y}$ : 종속변수(반응변수)$mathbf{X}$ : 고정효과 설계행렬 (독립변수, 설명변수)$boldsymbol{beta}$ : 고정효과 회귀계수$mathbf{Z}_a$ : 혈통 랜덤효과 설계행렬$mathbf{a}$ : 혈통 […]
유전 혼합선형모델 – ssGBLUP
데이터셋 설명형 데이터셋 – 관측 모의실험형 데이터셋 – 생성 통합형 데이터셋 검증형 데이터셋 모수가설검정 대응표본 t검정 독립표본 t검정 일원분산분석(1-way ANOVA) F검정 상관분석 t검정 단순선형회귀분석 F검정 단순선형회귀분석 t검정 비모수가설검정 교차분석 카이제곱검정 연관분석 카이제곱검정 다변량정규분포 예측모델 고정효과 선형모델 – ANOVA, BLUE 랜덤효과 선형모델 – BLUP 혈통 혼합선형모델 – PBLUP 유전체 혼합선형모델 – GBLUP 유전 혼합선형모델 – ssGBLUP […]